ClonArch: Visualizing clonal architecture

HCC Case Study HCC Reconstructed Simulation Screencast

1. Select a tree:

★CPXM2   
   UBR4   
   SLC30A2   
   TRIM63   
   OR4C13   
   NRXN2   
   [200 more]
♙ GCK   
  
♜ KIAA0427   
   GABRA1   
  
♞ A2M   
  
♠ MLL   
   CHUK   
  
♢ RIMS2   
  
♦ C15orf42   
   JAK2   
  
⚈ MUC16   
  
ℽ FLNB   
  
☁ LRP2   
  
☽ ITGB2   
  
☯ PPP1R3B   
  
★
★♠
★♢
★♦
★⚈
★ℽ
★☁
★♙
★♜
★♞
★♠☯
★♠☽

2. Select Mutations

3. Alter Clonal Frequency Thresholds

10% all